Историја филогенетских стабала
Историја филогенетике је дуга и сложена. Неколико научника створило је дијаграме дрвећа који су илустровали сродност организама, али нису користили еволутивне, наследне карактеристике да би формирали своја стабла на основу хипотетичких заједничких предака. Након што је Цхарлес Дарвин предложио своју теорију о еволуцији филогенетска стабла цвјетала су у својим правим облицима заснованим на насљедним карактеристикама.

Аугустин Аугиер

1801. Француски ботаничар Аугустин Аугиер створио је дрво живота које је назвао „Арбре Ботаникуе“. Овај цртеж детаљно приказује односе међу биљкама. Његово дрво живота било је врло детаљно и садржавало је различите чланове биљног царства који су додељени деблу дрвета, већим удовима, изданцима и лишћу.

Чини се погодним да ботаничар треба да створи прво признато филогенетско дрво, јер су ботаничари најсмелији поборници одустајања од класичне таксономије и искључиво прихватају филогенетску структуру.

Јеан-Баптисте Ламарцк

Јеан-Баптисте Ламарцк креирао је дрво дијаграма живота који је показао еволутивне односе међу животињама. Његово дрво живота прво је илустрирало насљедне особине, мада је Дарвин друге аспекте његове теорије касније оповргнуо. За разлику од оних који су дошли пре њега, своје је дрво засновао на везама предака и потомака.

Роберт Цхамберс

Роберт Цхамберс проучавао је фосилне доказе средином 1800-их. Роберт Цхамберс је 1844. године објавио врло једноставан филогенетски дијаграм у свом раду Вестигес природне историје стварања која илуструје повезаност гмазова, птица, риба и сисара.

Хајнрих-Георг Брон

Хеинрицх-Георг Бронн је такође конструирао дрво у свом раду на палеонтологији. Његов рад је посматран као прототип Дарвиновог стабла. Међутим, Дарвиново дрво је прво илустрирало еволуцијске односе. Сва друга описана стабла претходника само су користила дрво за организовање других биолошких информација. Дарвиново дрво било је прво дрво које је показало еволутивне односе хипотетичког заједничког претка.

Чарлс Дарвин

Цхарлес Дарвин је 1872. објавио своју чувену књигу, Порекло врста. Дарвин је постулирао да се врста развија природном селекцијом. Процес природне селекције омогућава одступање карактеристика насљедним насљеђивањем.

Дарвин је у своју књигу укључио дијаграм основног филогенетског стабла који је детаљно приказао његову визију угнијежђених врста и њихов однос према другим врстама. Овај важан почетак теорије филогенетике обележава чињеница да је ово био једини дијаграм који је Дарвин укључио у своје најпознатије дело.

У својој књизи Дарвин детаљно приказује своје виђење „великог стабла живота“ као сликовну метафору за међусобну повезаност врста преко предака и њихових потомака. Он повезује фракталну природу различитих родова, породица, подхрани и врста кроз гранање стабала. Он описује како су претходно формиране гране дрвета попут изумрле врсте која је сада засјењена процватим, зеленим изданцима новог раста. Ови зелени изданци представљају нову врсту која је еволуирала природном селекцијом због карактеристика које су им омогућиле да престигну своје претке.

Ернст Хаекел

Ернст Хаекел (1834-1919) прочитао је Дарвиново дело. Подржао је Дарвинову теорију еволуције и употребу филогенетског дијаграма или еволуционог стабла. Направио је неколико сопствених филогенетских дијаграма у својим истраживањима једноћелијских организама и људског порекла.

Хаецкел је вјеровао да може пратити људску линију кроз еволуцијско дрво живота до најнижих животних форми, за које је вјеровао да су једноцелични организми (данас знамо да ти једноћелијски организми - бактерије - у ствари и постоје. Он је отишао до великог дужине дијаграмирања еволуционих историја да илуструју његове две хипотезе. Формулирао је теорију познату као гастраје у којој се трудио да уђе у траг свим вишећелијским организмима све до хипотетичког заједничког претка.

Дијаграми његовог дрвета живота били су високо стилизовани. Изгледају сасвим другачије од једноставних дијаграма које данас користимо. Отишао је тако далеко да је детаљно нацртао измишљено дрво с лишћем, гранама и деблом дрвета које је било реално засенчено оловком.

Вилли Хенниг

Немачки зоолог Вилли Хенниг градио је на Дарвиновој теорији еволуције сопственом теоријом кладистике. 1950. године објавио је своје идеје на немачком. Његово дело је касније преведено на енглески језик под именом Филогенетска систематика. Предложио је како да се методички конструишу филогеније користећи хипотетичке заједничке претке, сестринске записе и наслеђене особине. Према друштву Вилли Хенниг, он је груписао врсте на основу синапоморфија (заједничких и изведених карактеристика организама). Те сличне карактеристике су познате и као хомолози.

Вилли Хенниг створио је основу модерних филогенетских стабала. Ми и данас користимо његове методологије за стварање ових филогенетских дијаграма стабала.Филогенетска стабла широко се користе у биологији за постављање организама у њихову еволуцијску и биолошку историју. Што више учимо о међуповезаним односима, лакше је конструирати комплетну еволуцијску историју свих организама на земљи.